位於西嶼鄉二崁村與大菓葉（池東）之間的「神秘三石窟」，久遠之前原是大片廢耕地（私有）與水庫預定地（公有）；後來有營建業者進駐開採石料，久經時日即成凹陷於地表的採石坑。
政府公告禁採砂石後，該採石坑即遭棄置；更在歲月變遷與物換星移之下，讓荒廢的採石坑積水成塘，終年不竭，並吸引無數魚雁穿梭其間，就連周遭地區也草木滋長茂盛，化身成三座「石窟秘境」。
多年前，其柱狀玄武岩節理與秀麗景觀被人無意間發現，幾經傳頌後，「大菓葉神秘三石窟」之名不脛而走，遊人漸增；至於原本的水庫預定地計畫，也因時空背景之變化，早已不符實際的經濟效益，而將原計畫全案取消。
其後，澎湖縣議會考量到遊客安全疑慮，特建議澎縣府在公有地部分闢建停車場，並於臨近石窟的道路旁增設木欄杆。至於進場道路部分，因多屬民間私有土地，故是否加以鋪設水泥或瀝青路面，仍有待進一步與地主溝通、協調。
由於該處景區為新興景點，且事涉諸多地權等問題，目前仍無明顯的道路及導覽指標，有意前往賞景者，可尋求「識途老馬」代為導覽及解說！
